南京上户口亲子鉴定是指在没有孩子出生证明时，父母在南京既无户口又无婚姻关系的情况下，采取的一种方式确认孩子的生物亲属关系的有关流程。为了保证亲子鉴定的准确和可靠性，采用了多种方法，让父母们得到公正的服务和调解。

一般来说，南京上户口亲子鉴定使用的方法主要有三种：首先，血缘分析测试是利用人类血液成分中的“DNA”这一生物信使，通过收集亲子双方的血液样本进行比对，以确定亲子关系。其次，婴儿脐带实验也是一种利用血液不同成分来确认亲子关系的有效方法，它通过收集孩子的脐带血样本来进行亲子关系的判断。最后，生命特征鉴定也可以用来确认亲子关系，它可以通过收集双方身体特征（如外形、肤色、唇形等）、表情、手迹和指纹特征等来进行比较，从而确定亲子关系。

此外，申请南京亲子鉴定，还需要完成一些手续。首先，需要提供家长双方身份证复印件和护照，以确认是否满足上户口的条件。其次，孩子出生后，家长需要前往有关单位，提供完整的身份证书将孩子的户口落到南京。最后，需要准备一系列文件，并包括亲子双方的出生证明、亲子关系登记表、结婚证明及其他与亲子关系有关的证据。

总的来说，南京上户口亲子鉴定使用的方法有血缘分析测试、婴儿脐带实验和生命特征鉴定等，申请时需要提供完整的身份证书及相应文件，整个流程都是相当复杂和时间较长的。因此，建议家长们及时搜集所需文件，尽量缩短办理时间。